Lees hier de samenvatting en de meest belangrijke oefenvragen van Bouwstenen van het Leven

• Eiwit structuur en dynamiek

  Dit is een preview. Er zijn 19 andere flashcards beschikbaar voor hoofdstuk 31/03/2021
  Laat hier meer flashcards zien

• Noem de onderdelen!Je hebt keuze uit de volgende mogelijkheden:ProtonCaCarboxyl-groepSide chainAmino-groep 

  1. Proton
     
  2. Ca
  3. Carboxyl-group
  4. Side chain
  5. Amino-group

• Asparagine is een ongeladen, polair aminozuur. Het heeft een zuurstof- en een aminogroep in zijn zijketen.Waarom is het niet geladen? 

  De nitrogen blijft unprotonated
  Je zou kunnen verwachten dat de stikstof een teveel aan elektronen vasthoudt waardoor het een extra proton zou kunnen opnemen en een positieve lading zou toevoegen. De aangrenzende zuurstof concurreert echter met de stikstof voor elektronen, en het resultaat is onvoldoende elektronendichtheid op beide atomen.

• Niet-polaire aminozuren herbergen uitsluitend koolstof- en waterstofatomen in hun zijketens. Waarom zijn ze dan niet-polair?  

  Het verschil in elektronegativiteit is te klein tussen C en H. De elektronegativiteit van koolstof en waterstof verschilt niet veel. Als gevolg hiervan blijven elektronen waar ze zijn en worden ze niet herverdeeld in het molecuul. Er wordt dus geen polariteit aangeroepen.

• In een gevouwen eiwit zijn de meeste niet-polaire aminozuren begraven in de eiwitvouw, terwijl de polaire en geladen zijketens worden blootgesteld aan de componenten in het cytosol. Deze vouw is stabieler vanwege de uitdrijving van niet-polaire atomen door contact met water, waardoor de interactie van niet-polaire atomen met elkaar wordt bevorderd. Hoe wordt dit vierde type niet-covalente interactie genoemd?

  Hydrofoob effect, dik komt door het hydrofobe effect

• Eiwit functie

  Dit is een preview. Er zijn 8 andere flashcards beschikbaar voor hoofdstuk 31/03/2021
  Laat hier meer flashcards zien

• Hoeveel structuren telt de eiwitdatabase op dit moment?

  Meer dan 100000

• Welk licht heeft meer energie, blauw of rood?

  Blauw, blauw licht heeft een kortere golflengte dan rood licht (ongeveer 400 nm in vergelijking met 700 nm). De formule > E=hc / λ, met golflengte λ in de noemer, levert een langere golflengte kleinere energie op.

• Waar is de extra binding en de daaropvolgende oxidatie in de ruggengraat van de GFP-chromofoor goed voor?

  Het breidt het π-elektronensysteem uit en stelt de chromofoor in staat zichtbaar licht te absorberen

• Wat gebeurt er met de kleur van het licht tijdens fluorescentie? Wat is de relatie tussen de golflengte van het geabsorbeerde en uitgezonden licht?

  De kleur verschuift naar grotere golflengten door het verlies van energie door botsingen

• De rijping van de GFP-chromofoor vereist alleen moleculaire zuurstof, O2. Waarom wordt dit als zo een groot voordeel beschouwd voor toepassingen in de cellulaire biologie?

  Het betekent dat cellen geen extra hulpmiddelen nodig hebben om fluorescentie vast te stellen

• Wat is het voordeel van de afscherming van de chromofoor tegen andere verbindingen die het van buiten de kooi benaderen?

  Opgeloste stoffen kunnen de chromofoor niet naderen en energie onttrekken door botsingen